新型冠状病毒感染应变协调中心表示，本澳于9月28日完成全民核酸检测，全部结果阴性；而红黄码区人士以及重点防控的对象，采取每天检验核酸的措施，全部结果皆为阴性。截至9月30日，已连续两天没有新增确诊病例。
路环高顶公共卫生临床中心目前有1例外地输入确诊者、1例外地输入复阳个案及6例输入相关病例确诊者，8位患者均病情稳定、无发烧、一般情况良好；另有5例康复期隔离者及45名密切接触者。
珠海早前公布，由澳门入境珠海隔离14日医学观察措施维持至今晚12时。应变协调中心表示，目前工作组已将本澳疫情的最新情况以及流调报告通报珠海，双方目前正就疫情风险进行分析，有最新的通关消息会尽快公布。呼吁市民不要急于前往口岸等待出关，口岸区域人员聚集不利于防疫。
教青局副局长龚志明表示，受疫情影响，本澳非高等教育学校自9月25日至10月3日停课，而各高等院校亦暂停面授教学活动。各高等院校恢复面授教学及非高等教育学校复课的日子，至今仍在分析，若有结果会尽快公布。虽然复课至今未有定案，但已与教育界保持密切沟通。高等院校早前暂停面授，但维持网课，问题不大；非高等教育学校亦已有预案。早前局方已建构网课平台提供予中小幼学校使用，并加强面向老师的网课培训。倘短期内未有复课决定，亦有充分预案保障学生的学习。
龚志明表示，经与教育界商讨及沟通，参照9月13日政府发出的接种疫苗新措施，10月25日起，教青局要求高等院校的教职员及学生、非高等教育教职员进入学校时，须持有至少1剂接种疫苗证明，或7天内核酸阴性证明。考虑到疫情发展的动态，学校是学生学习及集体活动的主要场所，为确保校园的安全及师生的健康，当局强烈呼吁各高等院校、非高等教育学校的教职员工接种疫苗。
第二次全民核检已结束，但有10名人士至今拒绝核检，当中9人被警方带往北安核检站付费进行核酸检测，并需要留在现场等待检测结果。余下1人坚持拒绝核检，并拒绝与警方合作，拒绝应门，目前双方仍在僵持中。警方相信最后能够促使该名人士进行核检。
金皇冠中国大酒店和金宝来酒店先后有6名保安确诊，对于住客的隔离期，卫生局传染病防制暨疾病监测部协调员梁亦好表示，当局原预计中国大酒店住客的隔离期至10月1日，但由于及后再多4名保安确诊，与早前评估的情况不同。为避免将病毒带入社区，需采取更谨慎措施，决定延长两酒店的医观时间至10月8日，稍后会将延长的讯息通知受影响的市民及旅客。不论现时已迁到喜来登酒店、路环高顶或其他医观酒店的住客，只要在19日至24日前入住中国大酒店及金宝来酒店的住客，都要延长医观期至10月8日。有关延长期是按病毒潜伏期14天计算。梁亦好又对受影响的住客致歉，表示这是基于防疫需要，确保病毒不进入社区。冀他们密切与当局合作，一起应对疫情。
应变协调中心表示，现时本澳整体疫苗接种率是53.2%。按年龄段分，接种率如下：12-19岁是29.5%，20-29岁是72%，30-39岁是76.9%，40-49岁是82.3%，50-59岁是60.3%，60-69岁是34.6%，70-79岁是19.3%，80岁以上是4.9%。目前疫苗接种的宣传重点目标是12至19岁，以及60岁以上的人群。应变中心强调身体越弱、年龄越大的人士越需要接种疫苗，倘若慢性病患者或长者不幸感染而又没有接种疫苗，重症率和死亡率比年轻人高出数十倍至一百倍。
仁伯爵综合医院医务主任戴华浩透露，本次6名输入相关确诊病例，仅1人有“咳一两声”，现在“连咳都无”。其余无明显症状。疫苗接种率倘若达到八、九成，就算染疫亦可能不会发病，或会被公众视为“感冒”，即所谓“与病毒共存”。目前本澳的疫苗接种率不高，仍需要严防死守。 就本澳宣传疫苗角度的转变，他表示，疫苗本来无法100%完全防护，其次病毒变种会让疫苗针对预防染疫的防护力下降，但新冠疫苗仍能很大机率预防重症及死亡。